产品货号:
YT190
中文名称:
生物素标记EMSA探针检测试剂盒
英文名称:
Chemiluminescent EMSA Kit
产品规格:
100次
发货周期:
1~3天
产品价格:
询价
本制品是一种通过Streptavidin-HRP及后续的BalbECL UT试剂来实现化学发光检测Biotin标记的EMSA探针的检测试剂盒。同时本试剂盒也提供了EMSA检测所需的结合缓冲液和上样缓冲液,及一些关键的相关试剂,可以实现非同位素的EMSA检测。
本试剂盒采用了高质量的Streptavidin-HRP Conjugate,HRP和Streptavidin共价交联的比例大于3,这样比采用Streptavidin和Biotin-HRP conjugate两种试剂进行检测要更方便,并且灵敏度更高。
本试剂盒采用了非特异性结合比avidin更低的strepatavidin,使检测结果背景更低灵敏度更高。本试剂盒和百奥莱博的各种生物素标记EMSA探针可以配套使用。
本试剂盒没有提供生物素探针标记相关的试剂,其它特定的生物素标记EMSA探针的制备可以使用生物素标记EMSA探针制备试剂盒。
EMSA/Gel-Shift结合缓冲液(5X)中含有poly(dI-dC)等有效成分。其中poly(dI-dC)的浓度经过优化,可以很好的消除蛋白和标记探针间的非特异性结合,同时又不会减弱目的转录因子和标记探针间的结合。
组分 | 规格 |
EMSA/Gel-Shift结合缓冲液(5X) | 200μL |
EMSA/Gel-Shift上样缓冲液(无色,10X) | 200μL |
EMSA/Gel-Shift上样缓冲液(蓝色,10X) | 200μL |
BalbECL UT A液 | 55mL |
BalbECL UT B液 | 55mL |
Streptavidin-HRP Conjugate | 100μL |
封闭液 | 380mL |
洗涤液(5X) | 250mL |
检测平衡液 | 250mL |
说明书 | 1份 |
保存条件:-20℃,避免反复冻融。
本试剂盒可以用于100个蛋白和探针的结合反应,并足够检测至少10块有生物素标记EMSA探针的膜。
- 需自备带正电荷尼龙膜,以及凝胶电泳时所需的相关试剂。。
- 如果需要使用更多的封闭液或洗涤液,可另外单独订购封闭液或洗涤液(5X)。
- BalbECL UT A液和B液均对人体有害,操作时请小心,并注意有效防护以避免直接接触人体或吸入体内。
- 探针的标记:
可以直接选购百奥莱博的生物素标记EMSA探针,或使用生物素标记EMSA探针制备试剂盒或其它合适的试剂盒进行EMSA探针的生物素标记。 - 探针的纯化和检测:
百奥莱博的各种生物素标记EMSA探针都已经过纯化,可以直接使用;对于使用生物素标记EMSA探针制备试剂盒等试剂盒标记的EMSA探针,通常为实验简便起见,可以不必纯化标记好的探针。有些时候,纯化后的探针会改善EMSA的电泳结果。详细的探针纯化和探针的标记效率的检测请参考EMSA探针生物素标记试剂盒的相关说明。 - EMSA胶的配制:
- 准备好倒胶的模具。可以使用常规的制备蛋白电泳胶的模具(例如BioRad的常规用于蛋白电泳的制胶装置),或其它适当的模具。最好选择可以灌制较薄胶的模具,以便于干胶等后续操作。为得到更好的结果,可以选择可灌制较大EMSA胶的模具。制胶前必须把制胶模具冲洗干净,需特别注意不能有SDS残留。
- 按照如下配方配制20mL 4%的聚丙烯酰胺凝胶(注意使用29:1等不同比例的Acr/Bis对结果影响不大)。
成分 用量 10×TBE buffer 1mL 重蒸水 16.2mL 39:1 acrylamide/bisacrylamide(40%,w/v) 2mL 80%甘油 625μL 10%过硫酸铵(ammonium persulfate) 150μL TEMED 10μL - 按照上述顺序依次加入各种试剂,加入TEMED前先混匀,加入TEMED后立即混匀,并马上加入到制胶的模具中。避免产生气泡,并加上梳齿。如果发现非常容易形成气泡,可以把一块制胶的玻璃板进行硅烷化处理。
- 准备好倒胶的模具。可以使用常规的制备蛋白电泳胶的模具(例如BioRad的常规用于蛋白电泳的制胶装置),或其它适当的模具。最好选择可以灌制较薄胶的模具,以便于干胶等后续操作。为得到更好的结果,可以选择可灌制较大EMSA胶的模具。制胶前必须把制胶模具冲洗干净,需特别注意不能有SDS残留。
- EMSA结合反应:
- 如下设置EMSA结合反应:
阴性对照反应: Nuclease-Free Water 7μL EMSA/Gel-Shift结合缓冲液(5X) 2μL 细胞核蛋白或纯化的转录因子 0μL 标记好的探针 1μL 总体积 10μL 样品反应: Nuclease-Free Water 5μL EMSA/Gel-Shift结合缓冲液(5X) 2μL 细胞核蛋白或纯化的转录因子 2μL 标记好的探针 1μL 总体积 10μL 探针冷竞争反应: Nuclease-Free Water 4μL EMSA/Gel-Shift结合缓冲液(5X) 2μL 细胞核蛋白或纯化的转录因子 2μL 未标记的探针 1μL 标记好的探针 1μL 总体积 10μL 突变探针的冷竞争反应: Nuclease-Free Water 4μL EMSA/Gel-Shift结合缓冲液(5X) 2μL 细胞核蛋白或纯化的转录因子 2μL 未标记的突变探针 1μL 标记好的探针 1μL 总体积 10μL Super-shift反应: Nuclease-Free Water 4μL EMSA/Gel-Shift结合缓冲液(5X) 2μL 细胞核蛋白或纯化的转录因子 2μL 目的蛋白特异抗体 1μL 标记好的探针 1μL 总体积 10μL - 按照上述顺序依次加入各种试剂,在加入标记好的探针前先混匀,并且室温(20~25℃)放置10分钟,从而消除可能发生的探针和蛋白的非特异性结合,或者让冷探针优先反应。然后加入标记好的探针,混匀,室温(20~25℃)放置20分钟。
- 加入1μL EMSA/Gel-Shift上样缓冲液(无色,10X),混匀后立即上样。
注意:有些时候溴酚蓝会影响蛋白和DNA的结合,建议尽量使用无色的EMSA/Gel-Shift上样缓冲液。如果对于使用无色上样缓冲液在上样时感觉到无法上样,可以在无色上样缓冲液里面添加极少量的蓝色的上样缓冲液,至可以观察到蓝颜色即可。
- 如下设置EMSA结合反应:
- 电泳:
- 用0.5×TBE作为电泳液。按照10V/厘米的电压预电泳10分钟。预电泳的时候如果有空余的上样孔,可以加入少量稀释好的1×的EMSA上样缓冲液(蓝色),以观察电压是否正常进行。
- 把混合了上样缓冲液的样品加入到上样孔内。在多余的某个上样孔内加入10μL稀释好的1×的EMSA/Gel-Shift上样缓冲液(蓝色),用于观察电泳进行的情况。
- 按照10V/厘米的电压电泳。确保胶的温度不超过30℃,如果温度升高,需要适当降低电压。电泳至EMSA/Gel-Shift上样缓冲液中的蓝色染料溴酚蓝至胶的下缘1/4处,停止电泳。
- 用0.5×TBE作为电泳液。按照10V/厘米的电压预电泳10分钟。预电泳的时候如果有空余的上样孔,可以加入少量稀释好的1×的EMSA上样缓冲液(蓝色),以观察电压是否正常进行。
- 转膜:
- 取一和EMSA胶大小相近或略大的尼龙膜,剪角做好标记,用0.5×TBE浸泡至少10分钟。尼龙膜自始至终仅能使用镊子夹取,并且仅可夹取不可能接触样品的边角处。
- 取两片和尼龙膜大小相近或略大的滤纸,用0.5×TBE浸湿。
- 把浸泡过的尼龙膜放置在一片浸湿的滤纸上,注意避免尼龙膜和滤纸间产生气泡。
- 非常小心地取出EMSA胶放置到尼龙膜上,注意确保胶和膜之间没有气泡。
- 再把另外一片浸湿的滤纸放置到EMSA胶上,注意确保滤纸和胶之间没有气泡。
- 采用Western时所使用的湿法电转膜装置或其它类似的电转膜装置,以0.5×TBE为转膜液,把EMSA胶上的探针、蛋白以及探针和蛋白的复合物等转移到尼龙膜上。对于大小约为10×8×0.1cm的EMSA胶,用BioRad的常用的Western转膜装置,电转时可以设置为380mA(约100V)转膜30~60分钟。如果胶较厚,则需适当延长转膜时间。转膜时需保持转膜液的温度较低,通常可以把电转槽置于4℃冷库或置于冰浴或冰水浴中进行电转,这样可以确保低温。具体的电转膜方法请参考电转膜装置的使用说明。
- 转膜完毕后,小心取出尼龙膜,样品面向上,放置在一干燥的滤纸上,轻轻吸掉下表面明显的液体。立即进入下一步的交联步骤,不可使膜干掉。
- 取一和EMSA胶大小相近或略大的尼龙膜,剪角做好标记,用0.5×TBE浸泡至少10分钟。尼龙膜自始至终仅能使用镊子夹取,并且仅可夹取不可能接触样品的边角处。
- 交联:
- 用紫外交联仪选择254nm紫外波长,120mJ/cm2,交联45~60秒。如果没有紫外交联仪可以使用普通的手提式紫外灯(例如我司的手提紫外检测仪),距离膜5-10厘米左右照射3~10分钟。也可以使用超净工作台内的紫外灯,距离膜5~10厘米左右照射3~15分钟。最佳的交联时间可以使用标准品自行摸索。
- 交联完毕后,可以直接进入下一步检测;也可以用保鲜膜包裹后在室温干燥处存放3~5天,然后再进入下一步检测。如果检测结果发现交联效果不佳,甚至连free probe的条带都非常微弱,可以考虑在膜干燥后参考步骤a的条件再交联一次,以进一步改善交联效果。
- 用紫外交联仪选择254nm紫外波长,120mJ/cm2,交联45~60秒。如果没有紫外交联仪可以使用普通的手提式紫外灯(例如我司的手提紫外检测仪),距离膜5-10厘米左右照射3~10分钟。也可以使用超净工作台内的紫外灯,距离膜5~10厘米左右照射3~15分钟。最佳的交联时间可以使用标准品自行摸索。
- 化学发光法检测生物素标记的探针:
- 37~50℃水浴溶解封闭液和洗涤液。
- 封闭液和洗涤液必须完全溶解后方可使用,封闭液和洗涤液可以在室温至50℃之间使用,但必须确保这两种溶液中均无沉淀产生,在冬天需特别注意。
- 取一合适的容器加入15mL封闭液,再放入交联过的含有样品的尼龙膜。在侧摆摇床或水平摇床上缓慢摇动15分钟。
- 取7.5μL Streptavidin-HRP Conjugate加入到15mL封闭液中(1:2000稀释),混匀备用。
- 去除用于尼龙膜封闭的封闭液,加入上一步中配制的15mL含有Streptavidin-HRP Conjugate的封闭液。在侧摆摇床或水平摇床上缓慢摇动15分钟。
- 取25mL洗涤液(5X),加入100mL重蒸水或Milli-Q级纯水,混匀配制成125mL洗涤液。
- 将尼龙膜转移至另一装有15~20mL洗涤液的容器内,漂洗1分钟。
- 去除洗涤液,加入15~20mL洗涤液,在侧摆摇床或水平摇床缓慢上洗涤5分钟。
- 重复步骤g三次(共洗涤四次),每次洗涤时间都约为5分钟。
- 将尼龙膜转移至另一装有20~25mL检测平衡液的容器内,在侧摆摇床或水平摇床上缓慢摇动5分钟。
- 取5mL BalbECL UT A液和5mL BalbECL UT B液混匀,配制成BalbECL UT工作液。
- BalbECL UT工作液必须现配现用。说明:从本步骤起操作方法和注意事项同Western实验的荧光检测。
- 取出尼龙膜,用吸水纸吸去过多液体。立即将膜的样品面向上,放置到处于水平桌面上的洁净容器内或保鲜膜上。
- 在尼龙膜的表面小心加上步骤J配制好的共10mL BalbECL UT工作液,使工作液完全覆盖尼龙膜。室温放置2~3分钟。
- 取出尼龙膜,用吸水纸吸去过多液体。将尼龙膜放在两片保鲜膜或其它适当的透光薄膜中间,并固定于压片暗盒(也称片夹)内。
- 用X光片压片1~5分钟。可以先压片1分钟,立即显影定影,然后根据结果再调整压片时间;也可以直接分别压片30秒、1、3、5分钟或更长时间,然后一起显影定影观察结果。
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